O Conselho Científico da APST constitui um órgão, não necessariamente interno à APST, com o qual a APST tenta colaborar activamente, no sentido de se manter a par dos mais recentes avanços ao nível da investigação sobre a síndrome de Tourette. Este órgão é actualmente constituído por 4 elementos:
- Ângelo Dias, ex-membro da Assembleia Geral da APST;
- Catarina Farinha, ex-membro da Direcção da APST;
- Dr. Tiago Maia, investigador;
- Vasco Conceição, investigador e Vice-Presidente da APST.